sábado, 20 de julho de 2024

Bioestatística básica


 Σ   BIOESTATÍSTICA  χ

 

Profa Dra Izabel Cristina R da Silva 

belbiomedica@gmail.com


Visite também o nosso instagram: 
Parte I - 
Programas para cálculos estatísticos


Estatística Descritiva                                                                 


Cálculo das estatísticas-resumo:
  • média
  • moda
  • mediana
  • Intervalo Interquartil
  • desvio padrão
  • variância


Construir um blox-plot

Teste do Qui-quadrado                                                       


Cálculo das estatísticas:
  • Qui-quadrado (e o valor de P)
  • Exato de Fisher
  • Odds-ratio

0- Qui-quadrado para tabelas 2x2 simples

http://graphpad.com/quickcalcs/contingency1.cfm




1- Cálculo do qui quadrado para tabelas 2x2





1.a-Cálculo do Odds ratio  




2- Cálculo do qui quadrado para tabelas com até 6 linhas e/ou até 6 colunas



 3-Odds ratio (outra forma)

Coeficiente de correlação                                                 

 Coeficiente de correlação de Pearson                                




http://www.socscistatistics.com/tests/pearson/Default2.aspx
Interpretação:
  • \rho= 1 Significa uma correlação perfeita positiva entre as duas variáveis.
  • \rho= -1 Significa uma correlação negativa perfeita entre as duas variáveis - Isto é, se uma aumenta, a outra sempre diminui.
  • \rho= 0 Significa que as duas variáveis não dependem linearmente uma da outra. No entanto, pode existir uma dependência não linear. Assim, o resultado \rho=0 deve ser investigado por outros meios.
    OU 
    • 0.9 para mais ou para menos indica uma correlação muito forte.
    • 0.7 a 0.9 positivo ou negativo indica uma correlação forte.
    • 0.5 a 0.7 positivo ou negativo indica uma correlação moderada.
    • 0.3 a 0.5 positivo ou negativo indica uma correlação fraca.
    • 0 a 0.3 positivo ou negativo indica uma correlação desprezível.

    REGRESSÃO LINEAR                                                            


    https://www.graphpad.com/quickcalcs/linear1/

    Spearman's Rho                                                             

    https://www.socscistatistics.com/tests/spearman/default2.aspx



      Kendall's W for Ranks                             
    Teste de Hipóteses                                                              


                 Etapa 1 – Definição das Hipóteses nula e alternativa

    o   H0:
    o   HA:


                 Etapa 2 -  definição do nível de significância, amostragem e coleta dos dados
                Etapa 3- Escolha do teste estatístico



              3.1  Verificar a distribuição que os dados assumem:


    o   Teste de Shapiro Wilk



    §  P≥0,05 – distribuição normal – teste paramétrico
    §  P<0,05 – distribuição livre – teste não paramétrico

    Ou

    Construa um histograma com 10 barras





         Etapa 3.2 - Checar o desenho do experimento (n de grupos e relação entre as unidades)



    Paramétrico
    Não-Paramétrico
    Diferença entre 2 médias ou medianas
    Teste t de student


    http://www.evanmiller.org/ab-testing/t-test.html
    Teste U de Mann-Whitney

    http://www.socscistatistics.com/tests/mannwhitney/Default2.aspx
    Diferença entre 3 ou mais médias ou medianas
    ANOVA
    http://vassarstats.net/anova1u.html

    OU

     https://www.socscistatistics.com/tests/anova/default2.aspx
    Kruskal-Wallis

    https://www.socscistatistics.com/tests/kruskal/default.aspx

    OU
    https://astatsa.com/KruskalWallisTest/

    OU COM PÓS TESTE
    https://www.statskingdom.com/kruskal-wallis-calculator.html
    Diferença entre 2 médias ou medianas (pareadas)
    Teste t de student (pareado)

    http://vassarstats.net/tu.html

     ou

     https://www.graphpad.com/quickcalcs/ttest1.cfm
    Wilcoxon

    https://www.ai-therapy.com/psychology-statistics/hypothesis-testing/two-samples
    Diferença entre duas proporções
    Teste Exato de Fisher
    (frequências inferiores a 5%)
    Teste do Qui-quadrado

    http://vassarstats.net/odds2x2.html

     ou

    http://www.graphpad.com/quickcalcs/contingency1/



    Etapa 4 – Aplicação do teste e cálculo do P

     Etapa 5- Conclusão estatística

    Se p ≥ a è aceita Ho
    Se p < a è rejeita Ho


    em que o alfa é o nível de significância (geralmente de 5%)

     Etapa 6 – Estatística descritiva PARA MONTAGEM DA TABELA DE PUBLICAÇÃO
    http://m.calculatorsoup.com/calculators/statistics/descriptivestatistics.php

    Etapa6 - gráficos para teste com medianas.

    https://datatab.net/statistics-calculator/hypothesis-test

    OUTRAS ALTERNATIVAS PARA CÁLCULOS               


    1-Cálculo do Risco Relativo
    http://www.medcalc.org/calc/relative_risk.php
    2- Cálculo do Odds ratio (outra forma)

    http://www.medcalc.org/calc/odds_ratio.php

    3- ANOVA quando somente temos média, desvio padrão e N

     http://www.danielsoper.com/statcalc3/calc.aspx?id=43

     com os dados do resultado acima, calcular o teste de Tukey
    considerando MSerror e df erro para WITHIN

     http://faculty.vassar.edu/lowry/hsd.html
    4- ANOVA COM OUTROS PÓS TESTES

     http://astatsa.com/OneWay_Anova_with_TukeyHSD/_get_data/
    5- Mediana

     http://www.socscistatistics.com/descriptive/averages/Default.aspx
    6- Uma outra alternativa de cálculo para aplicações em Epidemiologia

     https://www.openepi.com/Menu/OE_Menu.htm

    7- Calcular o HW (Hardy-Weinberg Equilibrium Calculator for 2 Alleles)

    Hardy-Weinberg Equilibrium Calculator for 2 Alleles (had2know.org)


    1. Análise da Distribuição dos Dados

    Antes de escolher um teste, é importante verificar se os dados seguem uma distribuição normal. Para isso, você pode utilizar:

    • Teste de Shapiro-Wilk (para amostras pequenas, n < 50)
    • Teste de Kolmogorov-Smirnov (para amostras maiores)

    Se os dados forem não paramétricos, o que é comum em escalas ordinais, os testes a seguir são mais apropriados.

    2. Comparação Entre Grupos

    • Teste de Kruskal-Wallis → para comparar mais de dois grupos (exemplo: diferentes faixas etárias).
    • Teste de Mann-Whitney U → para comparar dois grupos (exemplo: homens vs. mulheres).

    3. Associação Entre Variáveis

    • Coeficiente de correlação de Spearman → para avaliar a relação entre duas variáveis ordinais.
    • Qui-quadrado de independência → para verificar associação entre variáveis categóricas.

    4. Análise de Concordância

    Se o questionário mede a mesma variável em diferentes momentos ou entre avaliadores:

    • Coeficiente Kappa de Cohen → para medir concordância entre dois avaliadores.
    • Coeficiente de Concordância de Kendall (W) → para avaliar concordância entre mais de dois avaliadores.

    -----------------------------------------------------

    • Para avaliar a confiabilidade de um questionário, você pode utilizar diferentes testes estatísticos, dependendo do tipo de escala e do objetivo da análise. Os principais testes são:

      1. Consistência Interna

      Avalia o quanto os itens do questionário estão relacionados entre si, ou seja, se medem a mesma coisa.

      • Alfa de Cronbach (α) → É o teste mais comum para escalas com múltiplos itens. Um valor de α > 0,7 indica boa confiabilidade.
      • Ômega de McDonald (ω) → Alternativa mais robusta ao Alfa de Cronbach, especialmente para escalas com poucos itens ou estrutura complexa.
      • Correlação item-total corrigida → Mede se cada item contribui para a confiabilidade total do questionário.

      2. Estabilidade Temporal (Teste-Reteste)

      Avalia se o questionário gera resultados consistentes ao longo do tempo.

      • Coeficiente de Correlação Intraclasse (ICC) → Mede a estabilidade das respostas em dois momentos.
      • Correlação de Spearman ou Pearson → Se os dados forem ordinais, Spearman é mais indicado. Para dados contínuos, usa-se Pearson.

      3. Concordância Entre Avaliadores

      Se o questionário for aplicado por diferentes avaliadores e você quiser medir a concordância das respostas:

      • Coeficiente Kappa de Cohen → Para avaliar concordância entre dois avaliadores.
      • Coeficiente de Concordância de Kendall (W) → Para três ou mais avaliadores.
      • Coeficiente de Correlação Intraclasse (ICC) → Quando as respostas são contínuas.

    Construção de gráficos                                 


    http://vassarstats.net/graphs1.html


    Como interpretar gráficos de metanálise.

    JUNIOR, Nelson Kautzner Marques. Meta-análise para os estudos do esporte e da atividade física. RBPFEX-Revista Brasileira de Prescrição e Fisiologia do Exercício, v. 8, n. 49, p. 732-761, 2014.
    http://www.rbpfex.com.br/index.php/rbpfex/article/view/695/649

    Amostragem                                                 
    Inferência para médias: comparação de duas amostras independentes

    Cálculos de tamanho da amostra quando o tamanho da população é conhecido ou não
    http://www.raosoft.com/samplesize.html
    ou
    Sample Size Calculator


    Inferência para proporções: comparação de duas amostras independentes

    http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/b2.html


    http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/n2.html

    Estudos de caso controle não pareados
    http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/caco.html
    Parte II -
    Materiais complementares



    Bancos de dados importantes
    Chupeta modificado
     https://www.dropbox.com/s/avlhp10gl6eldju/chupeta%20modificado.sav?dl=0

     Notas
    https://www.dropbox.com/s/huyu1avtgol6rrf/notas.sav?dl=0
    Cardiac
    https://www.dropbox.com/s/c3tpaitdyz687i0/cardiac.sav?dl=0
    Acne
    https://www.dropbox.com/s/oixenocfpmz3sj4/acne.sav?dl=0
    Atividades físicas
    https://www.dropbox.com/s/e4ywzm2lymtsgxn/atividades_fisicas.sav?dl=0

     Doadores de sangue
    https://www.dropbox.com/s/v7a6mfgdg5o59vz/BBDDonor.sav?dl=0
    Viabilidade para regressão linear múltipla
    https://www.dropbox.com/s/1x9tpbcoxc9h4i1/viabilidade%20pra%20regress%C3%A3o%20linear%20multipla.sav?dl=0
    AVEH para regressão logística
    https://www.dropbox.com/s/2b93ik7x0cw7toe/AVEH.sav?dl=0


    Banco Drug trial
    https://www.dropbox.com/s/430dz003g46juus/drugtrial.sav?dl=0

    Aulas e exercícios de fixação
    Aula padrão
    https://www.dropbox.com/s/qqn39534im3xx5u/reposi%C3%A7%C3%A3o%20laboro.pdf?dl=0


     EXERCICIOS
    https://www.dropbox.com/s/azuqmnrmtz6td2o/EXERCICIOS%20mais%20completos.docx?dl=0

     tese com banco
    https://www.dropbox.com/s/otf2bzu1xqja6xy/TESE%20QUE%20PUBLICOU%20O%20BANCOOOO.pdf?dl=0
    Materiais didáticos interessantes

     Livro:VIEIRA, Sônia. Introdução à bioestatística. 4. ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. 345 p. ISBN 9788535229851

     https://docente.ifsc.edu.br/gianpaulo.medeiros/MaterialDidatico/M%C3%A9todos%20Est%C3%A1tisticos/Bioestatistica_-_Introducao_a_Bioestatistica_-_Sonia_Vieira_-_4_ed.pdf

    Excelente roteiro para projeto de estudo clínico



    Cursos ministrados


    1- Minicurso Estatística aplicada à Biologia Molecular

    https://www.dropbox.com/s/czweejg2nhvmxv7/estatistica%20parte%201.pdf?dl=0


     2- Banco de dados                                                                                                      
    Apostila para montagem do banco de dados
    https://drive.google.com/file/d/0B62ZRtJHeAMgSjRNbk0yYmNNREU/view?usp=sharing

     planilha criada

     https://docs.google.com/spreadsheets/d/1CEoUprq6QMQMlLF4Y54iw8Cr6ofU_R4P0ku0hcypg2c/edit?usp=sharing

    3- SEIBIT                                                                                             



    exercícios
    https://www.dropbox.com/s/azuqmnrmtz6td2o/EXERCICIOS%20mais%20completos.docx?dl=0

    4- Estatística aplicada às Ciências Farmacêuticas                            
    SLIDES


    exercícios
    https://www.dropbox.com/s/azuqmnrmtz6td2o/EXERCICIOS%20mais%20completos.docx?dl=0
    link para postar gabarito dos questionários
    https://goo.gl/forms/L2swPERjKKQw768y2

    5- Metodologia Científica - Especialização em análises clínicas       


    SLIDES

     Bioestatística

    Exercícios
    https://www.dropbox.com/s/azuqmnrmtz6td2o/EXERCICIOS%20mais%20completos.docx?dl=0
    Livro

     Livro:VIEIRA, Sônia. Introdução à bioestatística. 4. ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. 345 p. ISBN 9788535229851

    Muito útil e interessante, mesmo para quem é de outras áreas. Um dos grandes obstáculos da ciência moderna é priorizar a conclusão e interesses sobre efetivamente mostrar os dados.

     https://arxiv.org/abs/1911.03509

    6- CONTROLE DE QUALIDADE  - Especialização em análises clínicas       


     SLIDES

     Aula 1 - Legislação aplicada a Laboratórios de Análises Clínicas

     https://www.dropbox.com/s/gsj5fei0tslp1eu/SEM%20OS%20EXERCICIOS%20AULA%201%202019.pdf?dl=0

     Aula 2- Estatística da Qualidade

     https://www.dropbox.com/s/2aaho41qezap2vy/aula%202%202019%20CORRETOOO.pdf?dl=0

    Exercícios

    Parte 1

     https://www.dropbox.com/s/31u8558mg30raqr/estudooo.pptx?dl=0
    Gabarito
    https://www.dropbox.com/s/7m18r6v4x1hi2zn/questoes%20comentadas%20rev.pptx?dl=0
    Parte 2
    https://www.dropbox.com/s/6foom0hvvlwfg1m/EXERC%C3%8DCIOS%20SOBRE%20GR%C3%81FICOS%20DE%20CONTROLE.pdf?dl=0

    Outros materiais


     Montar mapas de controle
    http://tools.westgard.com/qcplotter.html
    Resumo das regras de Westgard
    http://www.qualichart.com.br/lp/regras-de-westgard-regras-multiplas.html

     Livro
    https://www.dropbox.com/s/6ui03h0h5r2cvoe/guia_cq_2007_alta_res.pdf?dl=0


    7- Métodos quantitativos 1

    PLANO DE ENSINO


    SLIDES -PARTE 1
    BANCO DIETA A E B

     https://www.dropbox.com/s/ii2pnzwzegemvv9/dietaAeB.sav?dl=0

    REGRESSÃO LINEAR

     https://www.dropbox.com/s/0ak4lcgd2gwy8hk/regressa%C3%B5%20linear.ppt?dl=0

     Exercício de regressão linear múltipla

     http://regressao.wikispaces.com/file/view/REGRESS%C3%83O+LINEAR+MULTIPLA-um+exemplo.pdf

     Regressão logística

     https://www.dropbox.com/s/qttdjf5b597dudv/logistica.ppt?dl=0

     Exercício de R logística

     https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/3769787/mod_resource/content/1/09_RegressaoLogistica.pdf

     Estatística da Qualidade

     https://www.dropbox.com/s/2aaho41qezap2vy/aula%202%202019%20CORRETOOO.pdf?dl=0
    Montar mapas de controle

     http://tools.westgard.com/qcplotter.html
    Resumo das regras de Westgard

     http://www.qualichart.com.br/lp/regras-de-westgard-regras-multiplas.html

     Livro

     https://www.dropbox.com/s/6ui03h0h5r2cvoe/guia_cq_2007_alta_res.pdf?dl=0
    Artigo 1

    Artigo 2

    8- MPB- Métodos de pesquisa e Bioestatística


    Em conjunto com a Professora Dra Daniela Orsi

    Plano de ensino



    Seminários 

    1.  4 grupos (5 ou 6 alunos)
    2. Tempo de aprsentação: máximo de 20 min
    3. Escolher um artigo, no mínimo Qualis Capes B1, na área interdisciplinar, e não pode ser de revista predatória
    Para verificar o qualis de uma revista:

    Como saber se a revista é predatória:


    4- Apresentar a crítica aos artigos conforme o roteiro abaixo:

    Roteiro

    https://www.dropbox.com/s/c47eyj4qv2o2ve1/Roteiro%20DO%20TRABALHO%20%281%29.pdf?dl=0

     5- Levar 2 cópias do artigo impresso no dia
    6- Enviar os slides da apresentação para o email belbiomedica@gmail.com até o dia xxxxxxxxxxxxxxx. O primeiro slide deverá ter os componentes do grupo

    Livro:VIEIRA, Sônia. Introdução à bioestatística. 4. ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. 345 p. ISBN 9788535229851



     HULLEY, Stephen B. et al. Delineando a pesquisa clínica. 3. ed. (antigo)
    https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/3144051/mod_resource/content/1/Delineando%20a%20pesquisa%20clinica%20-%20uma%20abordagem%20epidemiol%C3%B3gica%20-%20staphen%20b.%20hulley%2C%20steven%20r.%20cummings-2.pdf

    9- Oficina de Produção Científica- ABMDF


    10 - 3o CBCO- Estatística aplicada a qualidade


    SLIDES

    Aula - Estatística da Qualidade

     https://www.dropbox.com/s/jijgdhbuogsjs8h/aula%202%202019%20pro%20cbcooooo.pdf?dl=0


    Exercícios


     https://www.dropbox.com/s/ne7ug30n5ogihwk/cbco%20questoes%20comentadas.pdf?dl=0


    Outros materiais


     Montar mapas de controle

     http://tools.westgard.com/qcplotter.html
    Resumo das regras de Westgard

     http://www.qualichart.com.br/lp/regras-de-westgard-regras-multiplas.html

     Livro

     https://www.dropbox.com/s/6ui03h0h5r2cvoe/guia_cq_2007_alta_res.pdf?dl=0





    11- ENADE FARMÁCIA- RESOLVENDO GRÁFICOS

    PARTE 1
    https://www.dropbox.com/s/kjapyn6a7p360am/ENADE%20FARM%C3%81CIA%20by%20bel%20PARTE%201%20.pdf?dl=0

    PARTE 2

    PARTE 3

    Leitura recomendada




    13- Curso de Especialização em Tecnologia de Medicamentos e Cosméticos



    aula Regressão:

    AULA CONTROLE: 


    AMBRÓSIO, Patrícia; GEIB, Lorena Teresinha Consalter. Sonolência excessiva diurna em condutores de ambulância da Macrorregião Norte do Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Epidemiologia e Serviços de Saúde, v. 17, n. 1, p. 21-31, 2008.



    para quem faltou 
    exercícios
    https://www.dropbox.com/s/azuqmnrmtz6td2o/EXERCICIOS%20mais%20completos.docx?dl=0

    Na parte 01, fazer  o cruzamento da variável dias de exposição contra todas do banco

    enviar para: belbiomedica@gmail.com

    14- Residência HCB





    AMBRÓSIO, Patrícia; GEIB, Lorena Teresinha Consalter. Sonolência excessiva diurna em condutores de ambulância da Macrorregião Norte do Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Epidemiologia e Serviços de Saúde, v. 17, n. 1, p. 21-31, 2008.

    Postado por às Nenhum comentário:
    Assinar: Postagens (Atom)